En condiciones anaeróbicas, el sulfuro de hidrógeno se forma a través de procesos biogénicos que tienen lugar principalmente en el biofilm del alcantarillado. Los nutrientes y los sulfatos penetran en la zona anaeróbica productora de sulfuros. La bacteria Desulfovibrio desulfricans reduce el sulfato (SO42-) a iones sulfuro (S2-). Los iones de sulfuro se difunden desde el biofilm del alcantarillado hasta las aguas residuales. Dependiendo del valor de pH, el ion sulfuro se convierte inmediatamente en bisulfuro (HS-) o sulfuro de hidrógeno (H2S).
Figura 1: proporciones del sulfuro en función del valor de pH.